測序在手,文章我有

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時間:2019-08-05
circRNA被鑒定為多種癌癥中的重要調(diào)節(jié)因子,但在LUSC中尚未見報道。于是,一篇影響因子11.878、以測序為基礎(chǔ)展開研究的文章應(yīng)運而生......

肺鱗狀細(xì)胞癌(lung squamous cell carcinoma ,LUSC)是非小細(xì)胞肺癌的主要亞型之一,而非小細(xì)胞肺癌占所有人類肺癌的80-85%。circRNA被鑒定為多種癌癥中的重要調(diào)節(jié)因子,但在LUSC中尚未見報道。于是,這篇影響因子11.878、以測序為基礎(chǔ)展開研究的文章應(yīng)運而生。

研究思路如下:
說明: E:\5.微信稿件+文獻(xiàn)\7.22-7.26\7.26.png


一、circTP63 is upregulated in LUSC. 測序發(fā)現(xiàn)circTP63在LUSC表達(dá)上調(diào).

1.通過對測序結(jié)果進(jìn)行分析及實驗驗證,選定circTP63為研究對象

2.在35對臨床樣本中進(jìn)行驗證

二、Characteristics of circTP63 in LUSC cells.分析circTP63序列

  1. 分析circTP63序列

  2. 檢測細(xì)胞系中circTP63的表達(dá),選定SW900、H1703用于功能缺失實驗, H226、H2170用于功能獲得實驗

說明: C:\Users\y107\AppData\Roaming\Tencent\Users\3005006148\QiDian\WinTemp\RichOle\2Q6]5(9C(W95C41)FNTS9_V.png
三、circTP63 promotes cell proliferation and tumor growth. circTP63促進(jìn)細(xì)胞增殖和腫瘤增長
   細(xì)胞實驗:

  1. 干擾 circTP63,抑制細(xì)胞生長

  2. 過表達(dá)circTP63,提高細(xì)胞活力

  3. 挽救實驗,表明circTP63的確可以促進(jìn)細(xì)胞增殖

說明: C:\Users\y107\AppData\Roaming\Tencent\Users\3005006148\QiDian\WinTemp\RichOle\}5[0N7SEEOYDGK77[40Z[_J.png

   體內(nèi)實驗:
  利用H2170建立裸鼠異種移植模型,發(fā)現(xiàn)circTP63促進(jìn)腫瘤生長。

四、circTP63 facilitates cell proliferation by targeting FOXM1.circTP63通過FOXM1促進(jìn)細(xì)胞增殖

  1. circTP63、mRNA共表達(dá)模式分析,得到25個可能的靶標(biāo)mRNA,其中FOXM1,KIF18B和BRCA1相關(guān)性位居前三

  1. 對測序結(jié)果進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)FOXM1在LUSC中顯著上調(diào)

  1.  在35對臨床樣本中驗證FOXM1的表達(dá),并檢測circTP63與mRNA表達(dá)的相關(guān)性,最終,選定FOXM1為主要候選目標(biāo)。


五、circTP63 relieves repression of miR-873-3p on FOXM1.circTP63具有ceRNA功能通過預(yù)測選定miR-873-3p后,利用熒光素酶報告系統(tǒng)、免疫沉淀進(jìn)行驗證。
說明: C:\Users\y107\AppData\Roaming\Tencent\Users\3005006148\QiDian\WinTemp\RichOle\X)6KPG[5V{PY@63~9EJEZ6L.png
六、CENPA and CENPB are regulated by circTP63 through FOXM1.circTP63通過調(diào)控FOXM1進(jìn)而調(diào)控CENPA/B,促進(jìn)細(xì)胞增殖

  1. 過表達(dá)circTP63,檢測8個候選基因表達(dá)水平發(fā)現(xiàn),CENPA,CENPB, CCNB1受circTP63調(diào)節(jié)

  2. 干擾FOXM1,circTP63對CENPA和CENPB的作用顯著減弱

說明: C:\Users\y107\AppData\Roaming\Tencent\Users\3005006148\QiDian\WinTemp\RichOle\}RV~NTTZHBBCIH9L[7[8Y]7.png
3.敲除CENPA和CENPB同時過表達(dá)circTP63,circTP63對細(xì)胞增殖的促進(jìn)作用降低
 
綜上所訴,circTP63作為ceRNA調(diào)控FOXM1,促進(jìn)肺鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)展。