m6ADD:疾病相關(guān)m6A數(shù)據(jù)庫

m6ADD 是一個(gè)包含經(jīng)過實(shí)驗(yàn)證實(shí)的m6A疾病數(shù)據(jù)和從高通量疾病m6A修飾譜中獲得數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫。m6A-疾病數(shù)據(jù)包括m6A基因組位置、疾病名稱、m6A蛋白、調(diào)控模式、組織/細(xì)胞系、實(shí)驗(yàn)方法和數(shù)據(jù)來源。 此外，該數(shù)據(jù)庫還開發(fā)了一個(gè)預(yù)測與 24 種癌癥相關(guān)的 m6A 調(diào)節(jié)蛋白的工具。

http://m6add.edbc.org/

l  Browse

用戶可以根據(jù)基因、疾病名稱和蛋白質(zhì)瀏覽條目，并單擊“詳細(xì)信息”列以獲取更多信息。

l  Search

用戶可以通過輸入關(guān)鍵字進(jìn)行搜索。 對于“Species”:可以選擇“人類”或“小鼠”，或兩者兼而有之。 對于“Differential Method”:用戶可以選擇一種方法進(jìn)行搜索。 需要注意的是，選擇“Intersect(M&R)”得到的結(jié)果是基于共享同一個(gè)基因，同時(shí)保留了兩種方法的結(jié)果。

l  m6A-Net

該模塊是從string database中篩選出得分大于 900 的 PPI 數(shù)據(jù)。用戶可以通過輸入不同的 m6A 基因來獲得與該基因交互的 PPI 網(wǎng)絡(luò)。但是該模塊中PPI 網(wǎng)絡(luò)最多可以顯示 30 個(gè)節(jié)點(diǎn)。用戶還可以點(diǎn)擊下面的按鈕鏈接到“DAVID”網(wǎng)站，對生成的基因集進(jìn)行功能注釋。

l  m6A-Regulator

用戶可以通過選擇癌癥類型和m6A調(diào)節(jié)因子來獲得與特定癌癥中m6A調(diào)節(jié)因子功能相似的基因列表。

點(diǎn)擊“Network Diagram”顯示PPI網(wǎng)絡(luò)：