eccDNAdb：染色體外環(huán)狀DNA數(shù)據(jù)庫

染色體外環(huán)狀DNA（Extrachromosomal circular DNA，eccDNA）是源自但獨立于染色體DNA的環(huán)狀DNA分子,在癌癥中的普遍存在，并且在癌基因擴(kuò)增和腫瘤進(jìn)展中起關(guān)鍵作用。通過全基因組測序（WGS）可以鑒定eccDNA（本公司提供WGS測序服務(wù)）。eccDNAdb使用TCGA和CCLE下載的基因表達(dá)和臨床數(shù)據(jù)研究eccDNA在癌癥中的作用。eccDNAdb目前包括1270個eccDNA，在分析了包括患者組織、患者來源的異種移植物和癌細(xì)胞系在內(nèi)的總共3395個腫瘤樣本（57種癌癥）后，在480個樣本（42種癌癥）中鑒定了這些eccDNA。共有54901個eccDNA基因被注釋并包含在數(shù)據(jù)庫中。通過整合基因表達(dá)、臨床信息和染色質(zhì)可訪問性數(shù)據(jù)，eccDNAdb使用戶能夠輕松確定eccDNA在人類癌癥中的生物學(xué)功能和臨床相關(guān)性。http://www.eccdnadb.org/

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點擊“ID”跳轉(zhuǎn)至詳細(xì)信息界面，可以進(jìn)一步了解eccDNA在不同疾病、細(xì)胞中的表達(dá)情況。

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