非編碼RNA(ncRNA)是許多細(xì)胞過(guò)程中的重要參與者,從正常發(fā)育到致癌轉(zhuǎn)化。最初,ncRNA被定義為缺乏開(kāi)放閱讀框架(ORF)的RNA轉(zhuǎn)錄物。然而,多條證據(jù)表明,某些ncRNA具有小的開(kāi)放閱讀框(smORF),可以翻譯成肽(長(zhǎng)度小于100個(gè)氨基酸)。從生物學(xué)角度來(lái)看,ncRNA編碼肽(ncPEPs)的生物起源、功能或結(jié)構(gòu)財(cái)產(chǎn)是否與編碼區(qū)的肽不同尚不確定。ncPEPs的生物發(fā)生似乎與其他肽不同,因?yàn)樗鼈兺ǔJ菑莫?dú)特的編碼序列smORF翻譯而來(lái)的,ncRNA smORF的序列通常以傳統(tǒng)的AUG起始密碼子開(kāi)始,以非典型的終止密碼子結(jié)束。
NcPEPs作為一類(lèi)新的重要功能分子,有助于維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的各種細(xì)胞過(guò)程,正逐漸受到人們的重視。功能性ncRNA編碼肽(FuncPEP)數(shù)據(jù)庫(kù)是專(zhuān)門(mén)用于實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證和功能表征的ncPEP的數(shù)據(jù)庫(kù),包括100多種功能性ncPEP以及編碼它們的ncRNA的信息,可以用于ncPEP的生物成因、結(jié)構(gòu)財(cái)產(chǎn)和功能。
https://bioinformatics.mdanderson.org/Supplements/FuncPEP/
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