經(jīng)典案例

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2017-08-08
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
單細(xì)胞測(cè)序
全外顯子測(cè)序
外泌體轉(zhuǎn)錄組測(cè)序? ? ??Small RNA 測(cè)序驗(yàn)證阿爾茨海默病的miRNA潛在標(biāo)記物......

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序


單細(xì)胞測(cè)序


全外顯子測(cè)序


外泌體轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

      

Small RNA 測(cè)序驗(yàn)證阿爾茨海默病的miRNA潛在標(biāo)記物


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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

1、cell: RNA-seq挖掘果蠅神經(jīng)元細(xì)胞特異性識(shí)別分子      

背景:信息處理依賴于神經(jīng)元之間突觸的精確傳遞模式,細(xì)胞特異性識(shí)別的調(diào)節(jié)機(jī)制尚缺乏了解。果蠅視覺系統(tǒng)的髓質(zhì)中,不同的神經(jīng)元形成不同的突觸連接。

方法:為鑒定果蠅神經(jīng)系統(tǒng)中與細(xì)胞識(shí)別特異性相關(guān)的分子,研究者對(duì)7種不同類型的突觸形成期的神經(jīng)元細(xì)胞進(jìn)行RNA-seq。

結(jié)果:每一類神經(jīng)元表達(dá)一組獨(dú)特的數(shù)百個(gè)編碼細(xì)胞表面蛋白和分泌蛋白的基因,免疫球蛋白(Ig)超家族的Dpr家族21個(gè)基因呈現(xiàn)差異表達(dá),不同的突觸對(duì)表達(dá)的Dpr 和 Dpr互作蛋白 (DIPs)相匹配。提示一對(duì)Dpr/DIP旁系同源基因可導(dǎo)致突觸連接的層次特異性模式。(TanL, Zhang KX, Matthew Y, et al.Ig Superfamily Ligand and Receptor Pairs Expressed in Synaptic Partners in Drosophila. Cell. 2015. )

  

圖1.  7種神經(jīng)元細(xì)胞的基因表達(dá)模式



單細(xì)胞測(cè)序

1、Seinence: 單個(gè)循環(huán)流細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示非經(jīng)典WNT信號(hào)通路在前列腺癌中的耐藥機(jī)制      

       雄激素剝奪療法(ADT)是常見的前列腺癌的治療手段,復(fù)發(fā)后雄激素受體(AR)抑制劑能夠增加去勢(shì)抵抗性前列腺癌的總體存活率,但其療效具有異質(zhì)性和短暫性。為研究前列腺癌細(xì)胞的異質(zhì)性和耐藥機(jī)制,研究人員采用液體活檢即對(duì)血液中的循環(huán)瘤細(xì)胞(CTCs)進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。

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