急性骨髓性白血病患者的單細胞的大規(guī)模平行數字轉錄組分析

急性骨髓性白血病患者的單細胞的大規(guī)模平行數字轉錄組分析

DOI: 10.1038/ncomms14049

參考文獻：Zheng G X Y, Terry J M, Belgrader P, et al. Massively parallel digital transcriptional profiling of single cells[J]. bioRxiv, 2016: 065912.

基于GemCode技術和液滴方法，F(xiàn)red Hutch團隊和10X Genomics 利用微流體平臺，提高單細胞轉錄組測序的效率。這種技術將帶有條形碼、索引分子、引物和其他凝膠珠與單細胞混合，油滴封閉6分鐘，約50%的細胞捕獲效率。每個液滴內發(fā)生逆轉錄反應，以便于獲得測序所需的帶有條形碼的cDNA, 能夠計算每個樣品中所有捕獲單細胞的mRNA表達。

單細胞轉錄組的研究有利于研究人員了解復雜的生物系統(tǒng)。10X Genomics和Fred Hutchinson癌癥研究中心的研究人員選取了29例樣本，檢測了250000個單細胞轉錄組。利用細胞系和合成RNA檢測單細胞測序系統(tǒng)的敏感性和發(fā)現(xiàn)稀有群體的能力；利用68000個外周血單核細胞系統(tǒng)區(qū)分了免疫群體；結合單細胞轉錄組測序數據的序列突變，檢測器官移植病人的骨髓單核細胞在宿主與供體細胞的嵌合情況。

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