在幾個惡性腫瘤中發(fā)現(xiàn)了幾個trna衍生的片段,參與細胞增殖、凋亡和侵襲性轉移。這些失調的片段能夠結合阿爾戈里的蛋白質和皮維蛋白來調節(jié)基因表達。一些新發(fā)現(xiàn)的trna基因片段被認為是治療癌癥的新生物標記和治療靶點。本文綜述了不同亞型的trna-衍生片段的生物起源和生物學功能,并討論了它們在癌癥進展中的分子機制。
tRFs( tRNA-derived fragments)是來源于tRNA前體或成熟的tRNA的非編碼小片段。最近的一些研究表明tRFs在多種腫瘤中異常表達,有些tRFs參與了某些惡性腫瘤的細胞增殖、凋亡和侵襲轉移,這些差異表達的tRFs主要通過結合AGO蛋白及PIWI蛋白調控基因的表達。此外一些研究表明tRFs還可以做腫瘤的biomarker及治療靶點。隨著越來越多的研究者的關注,tRF將成為下一個非編碼RNA的研究熱點。接下來小編為大家介紹幾個tRF常用數(shù)據(jù)庫,方便大家進行相關研究。
1、tRFdb http://genome.bioch.virginia.edu/trfdb/search.php
tRFdb數(shù)據(jù)庫主要收集了人,小鼠,線蟲等7個物種的tRFs序列,總共2513條序列,其中人的序列552條, 收集的序列不多. 該數(shù)據(jù)庫主要收集了tRF-1, tRF-3, tRF-5序列,并提供ID,序列兩種查詢方式.
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