EVAtlas：人類細(xì)胞外囊泡中ncRNA表達(dá)的綜合數(shù)據(jù)庫

活細(xì)胞釋放的細(xì)胞外囊泡（EVs）是信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞通訊的重要載體，尤其是遠(yuǎn)距離細(xì)胞之間的相互作用。從內(nèi)體系統(tǒng)分泌的外泌體和從質(zhì)膜脫落的微泡 （MVs）是 EVs 的兩個(gè)主要來源。EVs的內(nèi)容物包括來自源細(xì)胞的多種生物分子，如脂質(zhì)、蛋白質(zhì)、代謝物、DNA和RNA。非編碼 RNA (ncRNA) 是 EVs 中經(jīng)過充分研究的重要分子，可以傳遞到和調(diào)節(jié)靶細(xì)胞，并顯示出生理和病理特異性，可作為候選生物標(biāo)志物。ncRNA作為重要的調(diào)控成分在生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用，其表達(dá)譜在正常和疾病狀態(tài)下差異很大。例如，微小RNA（miRNA）、小核仁RNA（snoRNA）和轉(zhuǎn)移RNA（tRNA）的失調(diào)是腫瘤發(fā)生中的常見事件。

今天我們來講一個(gè)關(guān)于人類細(xì)胞外囊泡中ncRNA表達(dá)的數(shù)據(jù)庫：EVAtlas ( http://bioinfo.life.hust.edu.cn/EVAtlas)，該數(shù)據(jù)庫相關(guān)文章發(fā)表在Nucleic Acids Research期刊（IF=16.972）。數(shù)據(jù)庫包括24 種條件和 40 多種疾病的人類2030個(gè)EV（1506 sEV 和 524 lEV）small RNA測(cè)序數(shù)據(jù)，量化七種 ncRNA 類型（miRNA、snoRNA、piRNA、snRNA、rRNA、tRNA 和 Y RNA）的表達(dá)譜。

目前，EVAtlas是EV ncRNA表達(dá)最全面的資源，已成為該領(lǐng)域研究的關(guān)鍵資源。首先主頁如圖所示，簡單介紹了數(shù)據(jù)庫基本情況和EVs中小RNA表達(dá)。搜索框中可以直接搜索小RNA名稱，會(huì)顯示基本信息，組織、表達(dá)、體液表達(dá)、功能、TCGA中腫瘤表達(dá)、相關(guān)藥物和靶基因。

在左側(cè)我們可以根據(jù)樣本情況進(jìn)行篩選，包括肺、淋巴、胃等組織樣本，還有母乳、血清血漿和唾液等樣本

 
在Specific Expression界面，用戶可以 獲得24 種條件下 EV 中特異性表達(dá)的 ncRNA，點(diǎn)擊某一特定條件即可獲得相應(yīng)條件下特異性表達(dá)的ncRNA。

相信這一工具會(huì)加速項(xiàng)目進(jìn)展。