LnCeCell：lncRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫

在腫瘤微環(huán)境中，由于基因表達(dá)和調(diào)控的微調(diào)，細(xì)胞表現(xiàn)出不同的細(xì)胞行為。 細(xì)胞特異性基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的識別將有助于我們了解單個細(xì)胞的疾病病理，進(jìn)一步為精準(zhǔn)醫(yī)療做出貢獻(xiàn)。

為了根據(jù)“One Cell，One World”的觀點(diǎn)打開疾病個性化表征的新大門，研究人員構(gòu)建了綜合數(shù)據(jù)庫 LnCeCell，該數(shù)據(jù)庫記錄了來自25種癌癥、細(xì)胞特異性 lncRNA 相關(guān)的 ceRNA 網(wǎng)絡(luò)和基于高質(zhì)量已發(fā)表的文獻(xiàn)和單細(xì)胞基因組學(xué)數(shù)據(jù)的生物標(biāo)志物。http://www.bio-bigdata.net/LnCeCell/

該數(shù)據(jù)庫主要有以下7個分析模塊，因為操作比較簡單，所以接下來為您介紹其中的3個模塊：

1. Cell Map

點(diǎn)擊“CeRNA”，可以根據(jù)lncRNA/mRNA進(jìn)行搜索；點(diǎn)擊“Cell”,可以根據(jù)細(xì)胞類型進(jìn)行搜索。結(jié)果頁面的圖片均可下載。

2. Cell Location

該模塊可以查詢ceRNA的亞細(xì)胞定位。紅框標(biāo)注的細(xì)胞器為該基因在細(xì)胞中的定位：

3. Cell Network

該模塊可以對lncRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化展示：

該數(shù)據(jù)庫中收錄的數(shù)據(jù)均可進(jìn)行免費(fèi)下載：