m7G修飾摘要分享

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2024-06-25
m7G是tRNA和mRNA 5‘帽子的經(jīng)典修飾,而最近的研究表明在mRNA內(nèi)部也存在m7G修飾......

 

        m7GtRNAmRNA 5‘帽子的經(jīng)典修飾,而最近的研究表明在mRNA內(nèi)部也存在m7G修飾。METTL1-WDR4復(fù)合體是可將m7G加到tRNA和一部分mRNA內(nèi)部。目前已有基于抗體和化學(xué)方法的m7G檢測(cè)技術(shù)(m7G-MeRIP-Seqm7G miCLIP-Seq)。得益于這些技術(shù),mRNA內(nèi)部的m7G被認(rèn)為與翻譯相關(guān)。但是,考慮到m7GtRNA上的富集,今后的研究還需更謹(jǐn)慎的區(qū)別m7G在不同RNA上的功能。

最新相關(guān)文章摘要:

1. QKI shuttles internal m7G-modified transcripts into stress granules and modulates mRNA metabolism

Cell  IF = 64.5   2023.06

        N7-甲基鳥苷(m7G)修飾通常發(fā)生在mRNA 5 ‘cap tRNA / RNAs中,也存在于信使RNA (mRNA)內(nèi)部。盡管m7G-cap對(duì)mRNA前加工和蛋白質(zhì)合成至關(guān)重要,但mRNA內(nèi)部m7G修飾的確切作用尚不清楚。本研究報(bào)道了m7G內(nèi)部的mRNAQuaking protein (QKIs)選擇性識(shí)別。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析/繪制內(nèi)部m7G甲基組和QKI結(jié)合位點(diǎn),確定了1000多個(gè)具有保守的“GANGAN (N = A/C/U/G)”基序的高置信度m7G修飾和QKI結(jié)合的mRNA靶標(biāo)。引人注目的是,QKI7(通過(guò)C)與應(yīng)激顆粒(SG)核心蛋白G3BP1相互作用,并將內(nèi)部m7G修飾的轉(zhuǎn)錄物轉(zhuǎn)運(yùn)到SGs中,以調(diào)節(jié)mRNA在應(yīng)激條件下的穩(wěn)定性和翻譯。具體來(lái)說(shuō),QKI7降低了Hippo信號(hào)通路中必需基因的翻譯效率,從而使癌細(xì)胞對(duì)化療敏感??偟膩?lái)說(shuō),將QKIs描述為mRNA內(nèi)部m7G結(jié)合蛋白,可調(diào)節(jié)靶mRNA代謝和細(xì)胞耐藥性。

 

 

2. METTL1 promotes tumorigenesis through tRNA-derived fragment biogenesis in prostate cancer

Mol Cancer  IF = 37.3   2023.06

        越來(lái)越多的新證據(jù)強(qiáng)調(diào)了表轉(zhuǎn)錄組標(biāo)記在許多癌癥的發(fā)展中發(fā)揮的重要作用;然而,對(duì)改變的表轉(zhuǎn)錄組沉積在前列腺癌中的作用和意義知之甚少。在這里,我們發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)移RNA N7 -甲基鳥苷(m7G)轉(zhuǎn)移酶METTL1在原發(fā)性和晚期前列腺腫瘤中高度表達(dá)。在機(jī)制上,我們發(fā)現(xiàn)METTL1的缺失導(dǎo)致m7G tRNA甲基化的缺失,并促進(jìn)了一類來(lái)自5‘tRNA片段的新型小非編碼rna的生物發(fā)生。5’ tRNA衍生的小RNA引導(dǎo)翻譯控制,有利于腫瘤生長(zhǎng)抑制、干擾素途徑和免疫效應(yīng)器的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子的合成。在前列腺癌臨床前模型中,METTL1的敲低增加了促炎免疫細(xì)胞在腫瘤內(nèi)的浸潤(rùn),增強(qiáng)了對(duì)免疫治療的反應(yīng)??偟膩?lái)說(shuō),本研究結(jié)果揭示了METTL1導(dǎo)向的m7G tRNA甲基化在癌細(xì)胞翻譯控制和腫瘤生物學(xué)中的治療作用。

3. Structural basis of regulated m7G tRNA modification by METTL1-WDR4

Nature  IF = 64.8   2023.01

        RNA的化學(xué)修飾在許多生物過(guò)程中起著關(guān)鍵作用。N7-甲基鳥苷(m7G)tRNAs4-7大亞群完整性和穩(wěn)定性所必需的。甲基轉(zhuǎn)移酶1-WD重復(fù)包含蛋白4 (METTL1-WDR4)復(fù)合物是修飾某些tRNA可變環(huán)中的G46的甲基轉(zhuǎn)移酶,其失調(diào)驅(qū)動(dòng)許多癌癥類型的腫瘤發(fā)生。WDR4突變導(dǎo)致包括小頭畸形在內(nèi)的人類發(fā)育表型。METTL1-WDR4如何修飾tRNA底物并調(diào)控仍不清楚。在這里,我們通過(guò)對(duì)人METTL1-WDR4的結(jié)構(gòu)、生化和細(xì)胞研究表明,WDR4作為METTL1tRNA T-arm的支架,在tRNA結(jié)合后,METTL1αC區(qū)轉(zhuǎn)化成一個(gè)螺旋,與α6螺旋一起固定tRNA可變環(huán)的兩端。出乎意料的是,我們發(fā)現(xiàn)METTL1的無(wú)序N端區(qū)域是催化口袋的一部分,對(duì)甲基轉(zhuǎn)移酶活性至關(guān)重要。此外,我們發(fā)現(xiàn)METTL1 N端區(qū)域的S27磷酸化通過(guò)局部破壞催化中心來(lái)抑制甲基轉(zhuǎn)移酶的活性。我們的研究結(jié)果提供了tRNA底物識(shí)別和磷酸化介導(dǎo)的METTL1- WDR4調(diào)控的分子理解,并揭示了METTL1紊亂的N端區(qū)域與甲基轉(zhuǎn)移酶活性的關(guān)系。

4. METTL1-Mediated m7G tRNA Modification Promotes Lenvatinib Resistance in Hepatocellular Carcinoma

Cancer Research  IF = 11.2   2023.01

        酪氨酸激酶抑制劑lenvatinib是治療晚期肝細(xì)胞癌(HCC)的一線藥物。然而,其療效受到耐藥性的嚴(yán)重阻礙。深入了解lenvatinib耐藥的分子機(jī)制可以為改善和延長(zhǎng)反應(yīng)提供新的策略。在這里,作者對(duì)親本和lenvatinib耐藥的HCC細(xì)胞進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)篩選,發(fā)現(xiàn)tRNA N7-甲基鳥苷(m7G)甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物的兩個(gè)關(guān)鍵成分甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白-1 (METTL1)WD重復(fù)結(jié)構(gòu)域4蛋白(WDR4)lenvatinib耐藥細(xì)胞中顯著上調(diào)。敲低METTL1通過(guò)降低lenvatinib作用下肝癌細(xì)胞的增殖能力和促進(jìn)細(xì)胞凋亡來(lái)克服耐藥性。此外,過(guò)表達(dá)野生型METTTL1但不表達(dá)其催化死亡突變體誘導(dǎo)lenvatinib抗性。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)包括水動(dòng)力注射、皮下植入和原位異種移植小鼠模型,進(jìn)一步證明了METTL1/WDR4介導(dǎo)的m7G tRNA修飾在體內(nèi)促進(jìn)lenvatinib耐藥中的關(guān)鍵作用。從機(jī)制上講,METTL1促進(jìn)EGFR通路基因的翻譯,從而引發(fā)耐藥性。本研究揭示了METTL1介導(dǎo)的m7G tRNA修飾在促進(jìn)lenvatinib耐藥中的重要作用,為耐藥提供了有希望的預(yù)測(cè)標(biāo)記和干預(yù)靶點(diǎn)。

 

 

5. Eliminating METTL1-mediated accumulation of PMN-MDSCs prevents hepatocellular carcinoma recurrence after radiofrequency ablation

Hepatology  IF = 13.5   2023.04

背景及目的:

        射頻消融術(shù)(RFA)是肝細(xì)胞癌(HCC)的一種重要治療方法,但其復(fù)發(fā)率仍然與所有其他HCC治療方式一樣高。甲基轉(zhuǎn)移酶1 (METTL1)是一種用于m7G tRNA修飾的酶,據(jù)報(bào)道可促進(jìn)HCC的發(fā)展。在這里,作者評(píng)估了METTL1RFA (iRFA)不足后形成免疫抑制腫瘤微環(huán)境中的作用。

方法與結(jié)果:

        通過(guò)免疫組織化學(xué)和多重免疫熒光(mIF)染色,我們發(fā)現(xiàn)METTL1表達(dá)在RFA后復(fù)發(fā)的HCC中增強(qiáng),同時(shí)伴有CD11b+CD15+多形核-髓源性抑制細(xì)胞(PMN-MDSCs)的增加和CD8+ T細(xì)胞的減少。在機(jī)制上,熱介導(dǎo)的METTL1上調(diào)通過(guò)誘導(dǎo)髓源性抑制細(xì)胞增強(qiáng)TGF-β2的翻譯形成免疫抑制環(huán)境。肝臟特異性過(guò)表達(dá)或敲低METTL1顯著影響PMN-MDSCs的積累,并隨后影響CD8+ T細(xì)胞的浸潤(rùn)。完整RFA成功地消除了腫瘤,而與假手術(shù)相比,iRFA處理的小鼠表現(xiàn)出腫瘤生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移增強(qiáng),PMN-MDSC積累增加,CD8+ T細(xì)胞減少。通過(guò)抗Ly6G抗體阻斷METTL1-TGF-β2-PMN-MDSC軸,或敲低肝癌固有的METTL1Tgfb2,或TGF-β信號(hào)阻斷可顯著緩解iRFA誘導(dǎo)的腫瘤進(jìn)展,恢復(fù)CD8+ T細(xì)胞群。

結(jié)論:

        我們的研究揭示了METTL1在調(diào)節(jié)免疫抑制微環(huán)境中的關(guān)鍵作用,并證明阻斷METTL1-TGF-β2-PMN-MDSC軸可能是一種恢復(fù)抗腫瘤免疫和預(yù)防RFA治療后HCC復(fù)發(fā)的治療策略,值得進(jìn)一步的臨床研究。

 


參考文獻(xiàn):

         Zhao Z, Qing Y, Dong L, Han L, Wu D, Li Y, Li W, Xue J, Zhou K, Sun M, Tan B, Chen Z, Shen C, Gao L, Small A, Wang K, Leung K, Zhang Z, Qin X, Deng X, Xia Q, Su R, Chen J. QKI shuttles internal m7G-modified transcripts into stress granules and modulates mRNA metabolism. Cell. 2023 Jul 20;186(15):3208-3226.e27. doi: 10.1016/j.cell.2023.05.047. Epub 2023 Jun 27. PMID: 37379838; PMCID: PMC10527483.

        García-Vílchez R, A?azco-Guenkova AM, Dietmann S, López J, Morón-Calvente V, D'Ambrosi S, Nombela P, Zamacola K, Mendizabal I, García-Longarte S, Zabala-Letona A, Astobiza I, Fernández S, Paniagua A, Miguel-López B, Marchand V, Alonso-López D, Merkel A, García-Tu?ón I, Ugalde-Olano A, Loizaga-Iriarte A, Lacasa-Viscasillas I, Unda M, Azkargorta M, Elortza F, Bárcena L, Gonzalez-Lopez M, Aransay AM, Di Domenico T, Sánchez-Martín MA, De Las Rivas J, Guil S, Motorin Y, Helm M, Pandolfi PP, Carracedo A, Blanco S. METTL1 promotes tumorigenesis through tRNA-derived fragment biogenesis in prostate cancer. Mol Cancer. 2023 Jul 29;22(1):119. doi: 10.1186/s12943-023-01809-8. PMID: 37516825; PMCID: PMC10386714.

        Li J, Wang L, Hahn Q, Nowak RP, Viennet T, Orellana EA, Roy Burman SS, Yue H, Hunkeler M, Fontana P, Wu H, Arthanari H, Fischer ES, Gregory RI. Structural basis of regulated m7G tRNA modification by METTL1-WDR4. Nature. 2023 Jan;613(7943):391-397. doi: 10.1038/s41586-022-05566-4. Epub 2023 Jan 4. PMID: 36599985.

        Huang M, Long J, Yao Z, Zhao Y, Zhao Y, Liao J, Lei K, Xiao H, Dai Z, Peng S, Lin S, Xu L, Kuang M. METTL1-Mediated m7G tRNA Modification Promotes Lenvatinib Resistance in Hepatocellular Carcinoma. Cancer Res. 2023 Jan 4;83(1):89-102. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-22-0963. PMID: 36102722.

         Zeng X, Liao G, Li S, Liu H, Zhao X, Li S, Lei K, Zhu S, Chen Z, Zhao Y, Ren X, Su T, Cheng AS, Peng S, Lin S, Wang J, Chen S, Kuang M. Eliminating METTL1-mediated accumulation of PMN-MDSCs prevents hepatocellular carcinoma recurrence after radiofrequency ablation. Hepatology. 2023 Apr 1;77(4):1122-1138. doi: 10.1002/hep.32585. Epub 2022 Jul 8. PMID: 35598182.