ncEP:非編碼RNA編碼肽數(shù)據(jù)庫(kù)

        越來(lái)越多的證據(jù)表明，非編碼RNA（ncRNA），如lncRNA、circRNA和pri-miRNA，可以編碼蛋白質(zhì)或肽。ncEP是一個(gè)用于收集ncRNA編碼的蛋白質(zhì)或肽的數(shù)據(jù)庫(kù)，這些蛋白質(zhì)或肽已通過(guò)發(fā)表論文中的低通量實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了驗(yàn)證。ncEP包含由ncRNA編碼的蛋白質(zhì)或肽的特征，如名稱、序列、物種、基因組位置、組織或細(xì)胞系、實(shí)驗(yàn)方法、數(shù)據(jù)源和其他詳細(xì)信息。http://www.jianglab.cn/ncEP/index.html

Search

        用戶可以使用ncRNA名稱、ncRNA編碼的蛋白/肽名稱、染色體位置進(jìn)行搜索。

        以ncRNA名稱為例，選擇感興趣的ncRNA點(diǎn)擊“Search”:

        結(jié)果頁(yè)面展示編碼蛋白/肽的長(zhǎng)度、文獻(xiàn)來(lái)源等信息：

Browse

        用戶可以通過(guò)選擇感興趣的物種，瀏覽特定物種中已發(fā)表的ncRNA編碼蛋白/肽。

        以human為例，點(diǎn)擊“more”可以瀏覽具體信息：

Genome Browser

        選擇感興趣的物種（人/小鼠/果蠅）后，選擇特定的蛋白/肽，可以瀏覽蛋白/肽在基因組中的信息：