高分文章思路解讀--lncRNA和miRNA的最新調(diào)控機(jī)制
lncRNA和miRNA的最新調(diào)控機(jī)制--高分文章思路解讀
隨著非編碼RNA研究成果的不斷涌現(xiàn)，要發(fā)高分文章就需要尋找新的模型、研究最新的機(jī)制。目前 lncRNA染色質(zhì)調(diào)控和ceRNA機(jī)制的研究比較成熟，然而其作為miRNA cluster前體在腫瘤及耐藥上的作用研究還比較少。近日（10月16），范德堡大學(xué)的研究者在Nature Medicine（IF=29.8）上以“l(fā)ncRNA MIR100HG-derived miR-100 and miR-125b mediate cetuximab resistance via Wnt/β-catenin signaling”為題，報(bào)道了lncRNA作為miRNA cluster前體，誘導(dǎo)癌癥耐西妥昔單抗（cetuximab）的新機(jī)制。
亮點(diǎn)：
1、首次發(fā)現(xiàn)lncRNA MIR100HG 及其衍生的miR-100, miR-125b在藥物耐藥中的作用。
2、miR-100 和miR-125b cluster的協(xié)同耐藥作用。
3、GATA6和MIR100HG/ miR-125b的負(fù)調(diào)控回路。
研究思路：
1、3D細(xì)胞培養(yǎng)構(gòu)建耐藥細(xì)胞模型：作者使用3D細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)將cetuximab敏感的結(jié)直腸癌細(xì)胞連續(xù)4個(gè)月暴露在cetuximab中，獲得耐藥細(xì)胞。
2、篩查耐藥相關(guān)基因：作者對(duì)耐藥和非耐藥CRC細(xì)胞進(jìn)行全外顯子測(cè)序、全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和small RNA 測(cè)序，最后發(fā)現(xiàn)lnc MIR100HG、mir - 100和mir - 125b在耐藥細(xì)胞中上調(diào)。作者發(fā)現(xiàn)lnc MIR100HG是mir - 100和mir - 125b的宿主機(jī)因， 隨后利用qPCR、 FISH、TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)和不同耐藥程度細(xì)胞檢測(cè)表達(dá)，驗(yàn)證這幾基因在耐藥中上調(diào)。
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