microRNA整套技術(shù)服務(wù)(靶基因功能驗(yàn)證服務(wù),報(bào)告基因載體,過(guò)表達(dá)載體,穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株等等)

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microRNA整套技術(shù)服務(wù)(靶基因功能驗(yàn)證服務(wù),報(bào)告基因載體,過(guò)表達(dá)載體,穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株等等)

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 microRNA靶基因驗(yàn)證實(shí)驗(yàn) 

當(dāng)前,microRNA對(duì)靶基因的功能研究十分熱門。利用熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)尋找或驗(yàn)證microRNA對(duì)靶點(diǎn)作用性是不可或缺的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。英拜生物可為您提供microRNA報(bào)告基因載體構(gòu)建服務(wù),并可進(jìn)一步為您提供熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)服務(wù)。您只需要提供目的microRNA靶位點(diǎn)序列,本公司專業(yè)技術(shù)服務(wù)人員就可替您完成載體構(gòu)建,為您節(jié)省大量的時(shí)間和精力。
下圖為microRNA-reporter載體表達(dá)框架示意圖,具有多克隆位點(diǎn),方便插入目的靶點(diǎn)序列。psiCHECK-2載體用于終點(diǎn)法的細(xì)胞裂解物檢測(cè),包含螢火蟲熒光素酶基因,使海腎熒光素酶的表達(dá)水平歸一化,令該系統(tǒng)更可靠、重現(xiàn)性更好。使用psiCHECK-2載體時(shí),無(wú)須通過(guò)共轉(zhuǎn)染進(jìn)行歸一化。
        

 
英拜生物microRNA報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)流程:
  1. microRNA靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)

利用Targetscan,miRanda,PicTar軟件得到目的microRNA的預(yù)測(cè)靶點(diǎn)序列(客戶提供)。
  1. 獲得microRNA靶點(diǎn)序列

根據(jù)提供的靶序列,合成兩條互補(bǔ)的單鏈DNA模板?;蛘撸O(shè)計(jì)引物PCR擴(kuò)增目的microRNA靶基因3’UTR序列。
  1. microRNA靶序列克隆

將合成的兩條單鏈退火成雙鏈(具有粘性末端),或?qū)CR產(chǎn)物雙酶切,后連入經(jīng)過(guò)同樣雙酶切的miR-reporter載體中,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α。
  1. 陽(yáng)性克隆鑒定。

挑選轉(zhuǎn)化的菌落,PCR篩選含有插入片段的陽(yáng)性克隆,測(cè)序驗(yàn)證克隆的序列和目的microRNA靶序列一致。
  1. 細(xì)胞轉(zhuǎn)染準(zhǔn)備

將含目的microRNA靶基因的報(bào)告基因載體、內(nèi)參質(zhì)粒和microRNA mimics或microRNA negative control共轉(zhuǎn)染293T或Hela細(xì)胞。
  1. 熒光素酶檢測(cè)

共轉(zhuǎn)染細(xì)胞24-72h后,進(jìn)行雙熒光素酶檢測(cè),確定目的microRNA的靶基因。
  1. 突變實(shí)驗(yàn)

構(gòu)建miR-reporter載體(含突變靶位點(diǎn)的熒光素酶報(bào)告基因載體)與內(nèi)參質(zhì)粒、microRNA mimics或microRNA negative control共轉(zhuǎn)染293T或Hela細(xì)胞。共轉(zhuǎn)染細(xì)胞24-72h后,進(jìn)行雙熒光素酶檢測(cè),進(jìn)一步驗(yàn)確定目的microRNA的靶基因。
  1. 整理分析數(shù)據(jù),得出結(jié)論。

提供有microRNA靶序列的報(bào)告質(zhì)粒,以及內(nèi)參和對(duì)照質(zhì)粒各一份。甘油保存菌株各一支。附mir-reporter載體的說(shuō)明書,以及實(shí)驗(yàn)報(bào)告,包括載體構(gòu)建過(guò)程,鑒定記錄,測(cè)序報(bào)告,細(xì)胞轉(zhuǎn)染,熒光檢測(cè)。



注:
microRNA mimics與microRNA negative control由客戶提供或由本公司代購(gòu)(Dharmacon公司),也選用Pre-miR 與Pre-miR negative control(Ambion)或構(gòu)建microRNA過(guò)表達(dá)載體及對(duì)照載體(本公司可以構(gòu)建)。
 

 

 

 MicroRNA功能學(xué)實(shí)驗(yàn)

  • 細(xì)胞增殖試驗(yàn)

  • 細(xì)胞凋亡試驗(yàn)

  • 細(xì)胞周期試驗(yàn)

  • 細(xì)胞侵襲試驗(yàn)

  • 細(xì)胞遷移試驗(yàn)

  

服務(wù)流程:

構(gòu)建過(guò)表達(dá)microRNA載體以及對(duì)照載體或客戶提供人工合成寡核苷酸→轉(zhuǎn)染細(xì)胞系→qRT-PCR檢測(cè)目的MicroRNA前體的表達(dá)情況→分析目的MicroRNA與細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期、細(xì)胞侵襲、細(xì)胞遷移之間的調(diào)控關(guān)系→出具書面報(bào)告,qRT-PCR分析的原始數(shù)據(jù)

客戶提供:

MicroRNA前體(Ambion公司)或mimic 與寡核苷酸(即對(duì)照前體或control mimic)及細(xì)胞系。

公司提供:

MicroRNA表達(dá)載體的質(zhì)粒、質(zhì)粒測(cè)序圖、qRT-PCR分析的原始數(shù)據(jù)、結(jié)果分析的書面報(bào)告。

 

miRNA表達(dá)檢測(cè)

        定量檢測(cè)組織或細(xì)胞樣本中的miRNA是功能研究的第一步,有助于人們進(jìn)一步了解 miRNA與疾病發(fā)生及發(fā)展的關(guān)系,以便為疾病的早期診斷提供新的思路。本公司主要通過(guò)microRNA芯片、microRNA-Seq、microRNA PCR 芯片、實(shí)時(shí)定量PCR、原位雜交等多種方法檢測(cè)miRNA的表達(dá)情況。為您提供最優(yōu)質(zhì)的、全方位的技術(shù)服務(wù)。

1、microRNA芯片檢測(cè)服務(wù) http://www.biomart.cn/infosupply/7484330.htm

2、 microRNA PCR芯片檢測(cè)服務(wù) http://www.biomart.cn/infosupply/10966567.htm

3、microRNA-Seq檢測(cè)服務(wù)http://www.biomart.cn/infosupply/9632788.htm

4、microRNA定量PCR http://www.biomart.cn/infosupply/7484332.htm

miRNA芯片,microRNA-Seq數(shù)據(jù)深度發(fā)掘分析

a) 芯片,測(cè)序數(shù)據(jù)聚類分析

b) microRNA靶基因預(yù)測(cè)“TargetScanS”, “miRanda (miRBase)”,“miRGen”等數(shù)據(jù)庫(kù)

預(yù)測(cè)差異microRNA的所有靶基因。

c) 靶基因GO分析

根據(jù)Gene Ontology數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)靶基因進(jìn)行功能顯著分析,從而篩選顯著性功能的靶基因。

d) 靶基因pathway分析

根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)靶基因進(jìn)行Pathway分類,并進(jìn)行顯著性分析從而得到顯著性的Pathway分類。

e) 構(gòu)建的MicroRNA與基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

通過(guò)構(gòu)建MicroRNA與基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),可以從中找出hub基因及hub microRNA.

f) microRNA 、靶基因、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

microRNA也會(huì)受到轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控造成表達(dá)差異,通過(guò)系統(tǒng)研究轉(zhuǎn)錄因子與基因間的調(diào)控關(guān)系,可以為尋找重要轉(zhuǎn)錄因子及重要基因提供線索。

g) microRNA啟動(dòng)子分析及甲基化位點(diǎn)分析

當(dāng)microRNA研究日趨火熱,越來(lái)越多的研究者開始關(guān)注microRNA本身甲基化變化。MicroRNA基因的甲基化變化也是造成microRNA表達(dá)差異的重要原因。

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