microRNA整套技術服務(靶基因功能驗證服務,報告基因載體,過表達載體,穩(wěn)轉細胞株等等)

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microRNA整套技術服務(靶基因功能驗證服務,報告基因載體,過表達載體,穩(wěn)轉細胞株等等)

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 microRNA靶基因驗證實驗 

當前,microRNA對靶基因的功能研究十分熱門。利用熒光素酶報告基因檢測實驗尋找或驗證microRNA對靶點作用性是不可或缺的實驗技術。英拜生物可為您提供microRNA報告基因載體構建服務,并可進一步為您提供熒光素酶報告基因檢測實驗服務。您只需要提供目的microRNA靶位點序列,本公司專業(yè)技術服務人員就可替您完成載體構建,為您節(jié)省大量的時間和精力。
下圖為microRNA-reporter載體表達框架示意圖,具有多克隆位點,方便插入目的靶點序列。psiCHECK-2載體用于終點法的細胞裂解物檢測,包含螢火蟲熒光素酶基因,使海腎熒光素酶的表達水平歸一化,令該系統(tǒng)更可靠、重現性更好。使用psiCHECK-2載體時,無須通過共轉染進行歸一化。
        

 
英拜生物microRNA報告基因實驗流程:
  1. microRNA靶點的預測

利用Targetscan,miRanda,PicTar軟件得到目的microRNA的預測靶點序列(客戶提供)。
  1. 獲得microRNA靶點序列

根據提供的靶序列,合成兩條互補的單鏈DNA模板?;蛘撸O計引物PCR擴增目的microRNA靶基因3’UTR序列。
  1. microRNA靶序列克隆

將合成的兩條單鏈退火成雙鏈(具有粘性末端),或將PCR產物雙酶切,后連入經過同樣雙酶切的miR-reporter載體中,連接產物轉化大腸桿菌DH5α。
  1. 陽性克隆鑒定。

挑選轉化的菌落,PCR篩選含有插入片段的陽性克隆,測序驗證克隆的序列和目的microRNA靶序列一致。
  1. 細胞轉染準備

將含目的microRNA靶基因的報告基因載體、內參質粒和microRNA mimics或microRNA negative control共轉染293T或Hela細胞。
  1. 熒光素酶檢測

共轉染細胞24-72h后,進行雙熒光素酶檢測,確定目的microRNA的靶基因。
  1. 突變實驗

構建miR-reporter載體(含突變靶位點的熒光素酶報告基因載體)與內參質粒、microRNA mimics或microRNA negative control共轉染293T或Hela細胞。共轉染細胞24-72h后,進行雙熒光素酶檢測,進一步驗確定目的microRNA的靶基因。
  1. 整理分析數據,得出結論。

提供有microRNA靶序列的報告質粒,以及內參和對照質粒各一份。甘油保存菌株各一支。附mir-reporter載體的說明書,以及實驗報告,包括載體構建過程,鑒定記錄,測序報告,細胞轉染,熒光檢測。



注:
microRNA mimics與microRNA negative control由客戶提供或由本公司代購(Dharmacon公司),也選用Pre-miR 與Pre-miR negative control(Ambion)或構建microRNA過表達載體及對照載體(本公司可以構建)。
 

 

 

 MicroRNA功能學實驗

  • 細胞增殖試驗

  • 細胞凋亡試驗

  • 細胞周期試驗

  • 細胞侵襲試驗

  • 細胞遷移試驗

  

服務流程:

構建過表達microRNA載體以及對照載體或客戶提供人工合成寡核苷酸→轉染細胞系→qRT-PCR檢測目的MicroRNA前體的表達情況→分析目的MicroRNA與細胞增殖、細胞凋亡、細胞周期、細胞侵襲、細胞遷移之間的調控關系→出具書面報告,qRT-PCR分析的原始數據

客戶提供:

MicroRNA前體(Ambion公司)或mimic 與寡核苷酸(即對照前體或control mimic)及細胞系。

公司提供:

MicroRNA表達載體的質粒、質粒測序圖、qRT-PCR分析的原始數據、結果分析的書面報告。

 

miRNA表達檢測

        定量檢測組織或細胞樣本中的miRNA是功能研究的第一步,有助于人們進一步了解 miRNA與疾病發(fā)生及發(fā)展的關系,以便為疾病的早期診斷提供新的思路。本公司主要通過microRNA芯片、microRNA-Seq、microRNA PCR 芯片、實時定量PCR、原位雜交等多種方法檢測miRNA的表達情況。為您提供最優(yōu)質的、全方位的技術服務。

1、microRNA芯片檢測服務 http://www.biomart.cn/infosupply/7484330.htm

2、 microRNA PCR芯片檢測服務 http://www.biomart.cn/infosupply/10966567.htm

3、microRNA-Seq檢測服務http://www.biomart.cn/infosupply/9632788.htm

4、microRNA定量PCR http://www.biomart.cn/infosupply/7484332.htm

miRNA芯片,microRNA-Seq數據深度發(fā)掘分析

a) 芯片,測序數據聚類分析

b) microRNA靶基因預測“TargetScanS”, “miRanda (miRBase)”,“miRGen”等數據庫

預測差異microRNA的所有靶基因。

c) 靶基因GO分析

根據Gene Ontology數據庫對靶基因進行功能顯著分析,從而篩選顯著性功能的靶基因。

d) 靶基因pathway分析

根據KEGG數據庫對靶基因進行Pathway分類,并進行顯著性分析從而得到顯著性的Pathway分類。

e) 構建的MicroRNA與基因的調控網絡

通過構建MicroRNA與基因的調控網絡,可以從中找出hub基因及hub microRNA.

f) microRNA 、靶基因、轉錄因子調控網絡

microRNA也會受到轉錄因子調控造成表達差異,通過系統(tǒng)研究轉錄因子與基因間的調控關系,可以為尋找重要轉錄因子及重要基因提供線索。

g) microRNA啟動子分析及甲基化位點分析

當microRNA研究日趨火熱,越來越多的研究者開始關注microRNA本身甲基化變化。MicroRNA基因的甲基化變化也是造成microRNA表達差異的重要原因。

資料下載: microRNA靶基因驗證實驗.pdf 附件下載  miRNA熒光定量PCR技術服務.pdf 附件下載  

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