microRNA靶基因分析

                                                  mciroRNA靶基因分析
1．通過(guò)TargetScan, Mirbase, Miranda預(yù)測(cè)microRNA靶基因。
2．三個(gè)軟件預(yù)測(cè)的前200個(gè)靶基因，兩兩之間取交集選取共同靶基因。
3．每個(gè)軟件前50個(gè)靶基因與另外兩個(gè)軟件預(yù)測(cè)的所有靶基因相比，選取共同靶基因。
4．三個(gè)軟件預(yù)測(cè)的前10個(gè)靶基因，如不在基因列表之內(nèi)的，則加入列表中。
5．根據(jù)第4步得到的靶基因進(jìn)行顯著性GO功能集分析和顯著性Pathway分析,將GO和Pathway所包含的靶基因取交集。

6．所得靶基因根據(jù)三個(gè)軟件總得分排序(各自得分做標(biāo)準(zhǔn)化相加)。