m6A在脂肪發(fā)生過(guò)程中起著重要作用。然而,其機(jī)制在很大程度上仍不清楚。在這里,小編與大家分享一篇近期發(fā)表于AUTOPHAGY的文章“m6A mRNA methylation controls autophagy and adipogenesis by targeting Atg5 and Atg7”。我們證明了m6A通過(guò)靶向Atg5和Atg7在調(diào)控自噬和脂肪生成方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用。機(jī)制上,眾所周知的m6A去甲基酶FTO的下調(diào)降低了ATG5和ATG7的表達(dá),導(dǎo)致自噬體形成的衰減,從而抑制了自噬和脂肪生成。
結(jié)果:
1.FTO促進(jìn)自噬,進(jìn)一步促進(jìn)脂肪生成
為了探索FTO在自噬中的作用,我們首先對(duì)3T3-L1細(xì)胞進(jìn)行了功能缺失的研究。western blot實(shí)驗(yàn)表明,與對(duì)照細(xì)胞相比,F(xiàn)TO沉默顯著降低了LC3-II:I比值,增加了SQSTM1水平,表明自噬體形成缺乏穩(wěn)態(tài)(圖1A)。相反,HA標(biāo)記的FTO過(guò)表達(dá)顯著提高了LC3-II:I比值,減少了SQSTM1表達(dá),表明FTO與自噬呈正相關(guān)。此外,免疫熒光檢測(cè)顯示,HA-FTO過(guò)表達(dá)后形成較多的LC3小點(diǎn)(圖1B,C)。我們用透射電鏡分析了脂肪形成過(guò)程中自噬體的形成。發(fā)現(xiàn)FTO的沉默降低了自噬體的數(shù)量,表明自噬的激活程度降低。相反,F(xiàn)TO的過(guò)表達(dá)增加了細(xì)胞內(nèi)自噬體的數(shù)量(圖1D,E)。為了確定自噬是否受FTO過(guò)表達(dá)的影響,對(duì)照組和過(guò)表達(dá)的細(xì)胞分別使用或不使用其他自噬抑制劑治療。這進(jìn)一步證實(shí)FTO促進(jìn)自噬激活(圖1F,G)。
為了探討FTO是否通過(guò)自噬途徑影響脂肪生成,在脂肪生成過(guò)程中,對(duì)照組和FTO過(guò)表達(dá)的3T3-L1和豬前脂肪細(xì)胞分別使用或不使用自噬抑制劑。我們觀察到3-MA和 Baf A1治療可以逆轉(zhuǎn)增強(qiáng)的自噬,脂肪形成和FTO過(guò)表達(dá)細(xì)胞的甘油三酯積累(圖1H-J)。與表型一致,脂肪細(xì)胞標(biāo)記的mRNA和蛋白水平包括Pparg,F(xiàn)abp4和Cebpa在FTO過(guò)表達(dá)細(xì)胞明顯升高,通過(guò)3-MA或Baf A1處理可將FTO下調(diào)至正常水平(圖1K,L)。這些結(jié)果表明FTO通過(guò)促進(jìn)自噬促進(jìn)脂肪細(xì)胞分化。
2.FTO的下調(diào)降低了ATG5和ATG7的表達(dá),但沒(méi)有降低ULK1的表達(dá)
為了確定自噬中FTO的潛在靶基因,我們首先利用qPCR分析比較FTO敲低后自噬相關(guān)基因的mRNA表達(dá)情況。結(jié)果顯示,在FTO敲除后,Atg5和Atg7的mRNA水平顯著降低,而Ulk1沒(méi)有變化(圖2A)。另外,F(xiàn)TO的下調(diào)顯著下調(diào)了ATG5和ATG7蛋白水平。相反,我們發(fā)現(xiàn)ULK1和其他自噬相關(guān)蛋白,如ATG12和ATG16L1,并沒(méi)有發(fā)生顯著的變化(圖2B)。此外,我們檢測(cè)了ATG5和ATG7在脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中的表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)他們兩個(gè)都在早期增加,然后下降(圖2C)。這些數(shù)據(jù)表明,Atg5和Atg7可能是FTO的靶基因。
為了檢測(cè)ATG5和ATG7對(duì)自噬和脂肪生成的影響,我們分別用ATG5和ATG7 siRNA處理3T3-L1前脂肪細(xì)胞,并使用western blot檢測(cè)其敲除效率。結(jié)果表明,LC3II:I的比值在ATG5和ATG7基因敲除后下降,F(xiàn)TO蛋白表達(dá)未發(fā)生變化(圖2D,E),這與FTO與ATG5、ATG7的上游下游關(guān)系一致。此外,我們發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,F(xiàn)TO、ATG5和ATG7的缺失均顯著抑制脂肪生成和甘油三酯積累(圖2F-H)。而且FTO、ATG5或ATG7敲低均下調(diào)了脂肪細(xì)胞標(biāo)記基因的表達(dá)水平(圖2I,J)。這些結(jié)果表明ATG5和ATG7對(duì)3T3-L1前脂肪細(xì)胞的自噬和脂肪生成具有重要的功能。因此,我們將重點(diǎn)放在這兩個(gè)FTO的潛在目標(biāo)Atg5和Atg7上進(jìn)行進(jìn)一步的研究。
3.FTO通過(guò)靶向ATG5和ATG7影響自噬和脂肪生成
為了證實(shí)FTO是否通過(guò)影響ATG5和ATG7的表達(dá)而影響自噬和脂肪生成,我們首先驗(yàn)證了FTO的過(guò)表達(dá)顯著提高了ATG5和ATG7的mRNA水平(圖3A)。接下來(lái),我們進(jìn)行了搶救實(shí)驗(yàn),觀察到沉默ATG5可以逆轉(zhuǎn)FTO過(guò)表達(dá)3T3-L1細(xì)胞中上調(diào)的LC3-II:I比值(圖3B)。與ATG5相似,ATG7缺失也恢復(fù)了擴(kuò)增的LC3-II:I比值(圖3C),表明FTO通過(guò)調(diào)控ATG5和ATG7表達(dá)影響自噬。已有研究報(bào)道,ATG5和ATG7在前脂肪細(xì)胞中的下調(diào)通過(guò)抑制PPARG和CEBPA的表達(dá),抑制自噬,降低CEBPB的水平,阻礙脂肪分化計(jì)劃的啟動(dòng)。這增加了FTO通過(guò)Atg5和Atg7-Cebpb信號(hào)調(diào)控脂肪生成的可能性。如我們所料,我們發(fā)現(xiàn)FTO的強(qiáng)制表達(dá)促進(jìn)了CEBPB蛋白的表達(dá),而ATG5和ATG7的缺失則逆轉(zhuǎn)了CEBPB的表達(dá)(圖3D)。此外,敲低ATG5 和ATG7可恢復(fù)FTO過(guò)表達(dá)促進(jìn)的3T3-L1細(xì)胞的脂肪生成和甘油三酯積累(圖3 E-G)。FTO過(guò)表達(dá)細(xì)胞中Pparg、Fabp4和Cebpa 的表達(dá)水平的升高也被逆轉(zhuǎn)(圖3H,I)??偟膩?lái)說(shuō),F(xiàn)TO通過(guò)介導(dǎo)Atg5和Atg7-Cebpb信號(hào)軸促進(jìn)脂肪生成。
4.FTO以m6A依賴的方式調(diào)控ATG5和ATG7表達(dá)
為了進(jìn)一步闡明FTO在自噬調(diào)控中的潛在分子機(jī)制,我們構(gòu)建了野生型(FTO- wt)和催化突變體FTOR96Q (FTO- mut)質(zhì)粒,以確定是否需要FTO的去甲基酶活性。液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜證實(shí)FTO-WT或FTO-MUT異位表達(dá)對(duì)細(xì)胞m6A水平的影響(圖4A)。體外表達(dá)的FTO-WT顯著增加了3T3-L1和豬脂肪細(xì)胞的LC3-II:I比值(圖4B),這意味著FTO以去甲基化酶活性依賴的方式調(diào)節(jié)自噬。一致的是,表達(dá)FTO-WT的細(xì)胞在免疫熒光檢測(cè)中顯示LC3斑點(diǎn)顯著增強(qiáng)(圖4C,D)。此外,與FTO-MUT或空載體相比,F(xiàn)TO-WT的異位表達(dá)增加了自噬體的數(shù)量(圖4E,F(xiàn))。這些結(jié)果表明,F(xiàn)TO的去甲基化活性是前脂肪細(xì)胞自噬所必需的。接下來(lái),我們研究了FTO是否通過(guò)去甲基化影響ATG5和ATG7的表達(dá)。與FTO-MUT或空載體相比,體外表達(dá)的FTO-WT增加了ATG5和ATG7的蛋白和mRNA水平(圖4G)。另外,在Atg5和Atg7的3’UTR處發(fā)現(xiàn)m6A修飾(圖4I)。我們發(fā)現(xiàn),通過(guò)敲低FTO可以增加3T3-L1和豬前脂肪細(xì)胞的m6A水平(圖4J)。此外,MeRIP-qPCR檢測(cè)顯示,F(xiàn)TO敲除顯著提高了Atg5和Atg7 mRNA轉(zhuǎn)錄本的m6A水平(圖4K)。我們用RIP-qPCR,觀察到Atg5和Atg7分別與3T3-L1中HA標(biāo)記的FTO和豬前脂肪細(xì)胞中FLAG標(biāo)記的FTO相互作用,提示Atg5和Atg7是FTO的直接靶點(diǎn)(圖4L)。更重要的是,為了評(píng)估m(xù)6A對(duì)靶標(biāo)mRNA的修飾是否對(duì)FTO介導(dǎo)的基因調(diào)控是必要的,我們對(duì)3T3-L1細(xì)胞進(jìn)行了雙熒光素酶報(bào)告基因和誘變實(shí)驗(yàn)。FTO-WT的強(qiáng)制表達(dá)顯著促進(jìn)了Atg5和Atg7的野生型3’UTR片段的活性(圖4M)。當(dāng)m6A位點(diǎn)發(fā)生突變時(shí),這種增加被消除,說(shuō)明FTO通過(guò)m6A依賴方式調(diào)控ATG5和ATG7的表達(dá)。此外,染色分析顯示,F(xiàn)TO- WT促進(jìn)脂肪細(xì)胞分化和甘油三酯積累(圖4N,P),證實(shí)FTO的去甲基化活性是脂肪生成所必需的。
5.YTHDF2通過(guò)m6A依賴機(jī)制介導(dǎo)ATG5和ATG7的穩(wěn)定性和表達(dá)
為了進(jìn)一步解釋m6A甲基化與FTO靶基因蛋白豐度之間的負(fù)相關(guān)關(guān)系,我們首先研究了ATG5和ATG7的表達(dá)是否受到Y(jié)THDF2或YTHDF1的影響。與對(duì)照組相比,YTHDF2的過(guò)表達(dá)顯著降低了ATG5和ATG7蛋白水平(圖5A)。而YTHDF1的強(qiáng)制表達(dá)對(duì)ATG5和ATG7的表達(dá)無(wú)影響(圖5B),說(shuō)明ATG5和ATG7是YTHDF2的靶點(diǎn)。另外,通過(guò)RIP-qPCR檢測(cè),我們進(jìn)一步證實(shí)了Atg5和Atg7在3T3-L1和豬前脂肪細(xì)胞中都與標(biāo)記為FLAG的YTHDF2相互作用(圖5C)。接下來(lái),我們測(cè)試了Atg5和Atg7 mRNA上的m6A修飾是否對(duì)YTHDF2介導(dǎo)的基因調(diào)控至關(guān)重要。雙熒光素酶檢測(cè)顯示異位YTHDF2顯著下調(diào)攜帶野生型Atg5和Atg7片段的熒光素酶活性(圖5D)。為了研究YTHDF2是否通過(guò)介導(dǎo)mRNA的衰減來(lái)控制Atg5和Atg7的表達(dá),我們對(duì)3T3-L1細(xì)胞進(jìn)行了功能缺失研究。與對(duì)照細(xì)胞相比,YTHDF2的敲低提高了Atg5和Atg7的mRNA水平(圖5E)。mRNA穩(wěn)定性分析顯示,YTHDF2的缺失延長(zhǎng)了Atg5和Atg7 mRNA轉(zhuǎn)錄本的半衰期(圖5F)。此外,通過(guò)強(qiáng)制表達(dá)YTHDF2,可以部分逆轉(zhuǎn)FTO過(guò)表達(dá)3T3-L1時(shí)ATG5和ATG7蛋白水平的升高(圖5G)。YTHDF2過(guò)表達(dá)也部分逆轉(zhuǎn)了FTO過(guò)表達(dá)細(xì)胞中LC3-II:I比值的升高。此外,異位表達(dá)YTHDF2可以逆轉(zhuǎn)FTO過(guò)表達(dá)導(dǎo)致的脂肪生成和甘油三酯積累(圖5H-J)。
6.FTO可降低小鼠白色脂肪量,抑制ATG5和ATG7依賴的自噬
為了研究FTO在體內(nèi)脂肪組織中的作用,我們將Ftoflox/flox小鼠與Fabp4-Cre小鼠雜交,建立了脂肪選擇性FTO敲除小鼠(FTO-ako)模型。FTO-ako小鼠的白色脂肪組織中FTO的表達(dá)被有效地刪除(圖6A)。與胎鼠對(duì)照小鼠相比,fto-AKO小鼠不受普通飼料或高脂飲食(HFD)誘導(dǎo)的體重增加的影響,而兩組之間的食物攝入量沒(méi)有顯著差異(圖6B,C)。與對(duì)照組小鼠相比,fto-AKO小鼠取食普通食物和高脂飲食上都明顯變瘦(圖6D)。另外,fto-AKO小鼠的腹股溝脂肪和性腺脂肪墊的質(zhì)量分別顯著低于對(duì)照組小鼠(圖6E,F(xiàn))。haematine和伊紅染色顯示,取食HFD的小鼠脂肪細(xì)胞具有典型的結(jié)構(gòu),幾乎整個(gè)細(xì)胞被一個(gè)大的脂滴所占據(jù)(圖6G,H)。相反,F(xiàn)TO缺乏會(huì)導(dǎo)致多腔和較小的脂肪細(xì)胞。此外,喂食HFD的fto-AKO小鼠的血糖水平和血清甘油三酯水平明顯低于對(duì)照組小鼠(圖6I,J)。為了研究FTO是否影響體內(nèi)自噬,我們首先檢測(cè)了對(duì)照組和FTO-ako小鼠WAT中LC3-II:I和SQSTM1的表達(dá)水平。有趣的是,脂肪選擇性缺失的Fto顯著減弱了LC3-II:I比值,增加SQSTM1蛋白豐度(圖6K)。與體外研究一致,F(xiàn)TO缺乏減少ATG5和ATG7的蛋白和基因表達(dá)(圖6K,L)。綜上所述,這些結(jié)果表明,脂肪細(xì)胞選擇性敲除fto可以降低WAT的量,并抑制ATG5和ATG7依賴的小鼠自噬。
總結(jié):
我們的研究表明,F(xiàn)TO在m6A-YTHDF2依賴機(jī)制中,在促進(jìn)自噬和脂肪生成方面發(fā)揮著重要作用。我們的研究強(qiáng)調(diào)了m6A甲基化機(jī)制在自噬中的功能的重要性。這些發(fā)現(xiàn)為FTO和m6A修飾調(diào)節(jié)自噬和脂肪生成的分子機(jī)制,以及預(yù)防和治療肥胖的治療策略的發(fā)展提供了深入的了解。