lncRNA與核糖體RNA

    核糖體RNA（Ribosomal RNA，rRNA）是細胞內含量最多的一類RNA，結構復雜功能強大。長鏈非編碼RNA (Long non-coding RNAs, lncRNA)是近年來新發(fā)現(xiàn)的一類重要的調控分子，參與各類細胞生理和病理過程，成為許多研究者們所青睞的熱門領域。rRNA和lncRNA直接會摩擦出什么不一樣的火花呢？故事正在上演，跟隨小編一起來看看吧。別走開，這里的故事很精彩喲。

文章思路：

結果：
1. HOXB-AS3 lncRNA在健康造血細胞和急性髓性白血?。ˋML）細胞中的表達
    僅NPM1mut細胞系OCI-AML3中檢測到HOXB-AS3表達，六個野生型NPM1（NPM1wt）的AML細胞不表達。NPM1mut患者骨髓的HOXB-AS3表達高于NPM1wt患者或健康者，NPM1mut患者HOXB-AS3表達比NPM1wt患者增加了三倍。研究其亞細胞定位，發(fā)現(xiàn)細胞核部分HOXB-AS3更豐富。使用了蔗糖梯度分餾法，并在OCIAML3細胞中進行了靶向多聚體分析發(fā)現(xiàn)GAPDH和ACTB在低、高分子量多核糖體片段，而HOXB-AS3和MALAT1富含在游離部分。敲低OCI-AML3細胞中NPM1mut可導致NPM1mut RNA表達減少，NPM1wt mRNA表達增加，NPM1總蛋白量不變，突變型NPM1蛋白減少，NPM1mut的敲低導致HOXB-AS3 RNA豐度減少。攜帶人源化突變Npm1敲入等位基因（Npm1cA / +）的轉基因小鼠BM細胞中l(wèi)ncRNA轉錄本Hoxb5os表達上調。

2.HOXB-AS3調節(jié)AML細胞的增殖
    OCI-AML3細胞敲低HOXB-AS3，敲低導致S期OCI-AML3細胞減少，G2 / M期細胞的增加，細胞克隆能力減弱。過表達HOXB-AS3導致增殖比例增加。

3. HOXB-AS3基因在AML患者中表達的功能意義
    三個AML患者細胞敲除HOXB-AS3降低細胞的克隆數(shù)量。把患者AML細胞植入白消安預處理的NOD-scid IL2Rgammanull（NSG）小鼠，用抗HOXB-AS3 gapmers處理對體內的HOXB-AS3進行敲低，HOXB-AS3的敲低延長異種移植小鼠的存活。Hoxb5os的破壞導致BFP陽性細胞逐漸減少。

4.ErbB3結合蛋白1（EBP1）與HOXB-AS3相互作用
    lncRNA通過與特定蛋白質相互作用來調節(jié)關鍵的細胞過程。使用生物素化探針來捕獲HOXB-AS3 lncRNA或U1轉錄本，鑒定出7個候選分子，EBP1反應最強。EBP1是一種RNA結合蛋白，在核仁中與NPM1相互作用并調節(jié)rRNA的成熟。在OCI-AML3細胞核裂解物中檢測EBP1-NPM1相互作用，OCI-AML3細胞敲除HOXB-AS3導致EBP1和NPM1相互作用的數(shù)量減少。

5.HOXB-AS3-EBP1-NPM1復合物調節(jié)rRNA轉錄
    OCI-AML3細胞中敲低HOXB-AS3導致rRNA的轉錄降低，RNA聚合酶I對rDNA啟動子的占用減少，40S和60S核糖體亞基、80S和多核糖體形成減少，OCI-AML3細胞蛋白質合成減少。過表達HOXB-AS3則有相反效果。HOXB-AS3 的敲低減少了綁定到rDNA啟動的子EBP1的數(shù)量，HOXB-AS3結合的DNA中有rDNA啟動子區(qū)域的富集。

6.HOXB-AS3-EBP1相互作用的特點
    構建五個HOXB-AS3截短的變體，每個變體依次缺少?100個核苷酸。K-562細胞中過表達HOXB-AS3wt和HOXB-AS3截短變體發(fā)現(xiàn)變體2與EBP1相互作用降低，變體2綁定較少的EBP1蛋白。只有完整的HOXB-AS3序列和變體1可增加rRNA的豐度和產生增殖表型。HOXB-AS3區(qū)域5的刪除廢除了在HOXB-AS3wt和其他截短的變體中觀察到的rDNA啟動子序列的富集，表示區(qū)域5是HOXB-AS3與rDNA啟動子相互作用所必需。

總結：
HOXB-AS3在NPM1mut AML中的功能作用
1.健康狀態(tài)：NPM1蛋白處于野生型結構，駐留在核仁中并調節(jié)核糖體的生物發(fā)生。
2.NPM1突變導致核仁中NPM1蛋白的量減少，轉錄rRNA的總量減少；還導致HOXB-AS3 lncRNA異常上調，HOXB-AS3與EBP1相互作用并引導EBP1進入核仁，EBP1的增加量與殘留NPM1相互作用，增加轉錄rRNA的輸出。