巨噬細(xì)胞的差異激活與腫瘤進(jìn)展密切相關(guān),而表觀遺傳因子賴氨酸去甲基化酶6B (KDM6B,先前命名為JMJD3)通過(guò)一種未知的機(jī)制調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞的極化。本文探討了該調(diào)解機(jī)制及其功能,并于2021年5月發(fā)表在《Theranostics》IF:8.579期刊上。
技術(shù)路線:
主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:
1、巨噬細(xì)胞KDM6B的表達(dá)被miR-138-5p抑制
根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道KDM6B是巨噬細(xì)胞的激活的關(guān)鍵分子,因此,作者首先檢測(cè)了乳腺癌細(xì)胞系MB-MDA-231對(duì)巨噬細(xì)胞系TPH-1中KDM6B表達(dá)的影響,結(jié)果表明乳腺癌細(xì)胞及其條件培養(yǎng)基都可顯著下調(diào)KDM6B的表達(dá),表明存在一種乳腺癌細(xì)胞來(lái)源的分泌因子產(chǎn)生此種影響。因此,通過(guò)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)了KDM6B結(jié)合的miRNA,以及結(jié)合文獻(xiàn),通過(guò)在乳腺癌中上調(diào)的,同時(shí)符合條件的有3個(gè)。隨后將乳腺癌細(xì)胞和巨噬細(xì)胞共培養(yǎng),檢測(cè)三個(gè)miRNA的表達(dá),如圖1B所示,只有miR-138-5p和miR-146a的表達(dá)在共培養(yǎng)后顯著上調(diào)。進(jìn)一步檢測(cè)發(fā)現(xiàn),只有miR-138-5p處理后KDM6B的表達(dá)顯著下降而非miR-146a(圖1C-D)。生信分析預(yù)測(cè)了miR-138-5p和KDM6B的結(jié)合位點(diǎn),并進(jìn)行了熒光素酶實(shí)驗(yàn)檢測(cè),證實(shí)了兩者間存在結(jié)合關(guān)系。
圖1 miR-138-5p抑制巨噬細(xì)胞KDM6B的表達(dá)
2、miR-138-5p介導(dǎo)癌細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制
構(gòu)建了miR-138-5p過(guò)表達(dá)的乳腺癌細(xì)胞系,取其培養(yǎng)基與巨噬細(xì)胞共培養(yǎng),結(jié)果巨噬細(xì)胞中miR-138-5p表達(dá)顯著上調(diào),同時(shí)KDM6B的表達(dá)顯著下降。證實(shí)miR-138-5p介導(dǎo)癌細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制。
圖2 miR-138-5p介導(dǎo)癌細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制
3、癌細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-138-5p下調(diào)KDM6B的表達(dá)
隨后為了判定上述巨噬細(xì)胞中miR-138-5p表達(dá)上調(diào)的原因,檢測(cè)了巨噬細(xì)胞中原代(pri-)和前體(pre-) miR-138的水平。結(jié)果顯示共培養(yǎng)和對(duì)照組間原代和前體miR-138的水平?jīng)]有差異,表明miR-138-5p是外源供應(yīng)的(圖1A)。此外,使用RNase A處理miR-138-5p水平不變,使用Triton X-100其水平顯著下降。提示miR-138-5p被膜狀結(jié)構(gòu)包裹(圖1B)。進(jìn)一步分析表明使用外泌體抑制劑GW4869處理組和外泌體刪除組的培養(yǎng)基中miR-138-5p的表達(dá)顯著下降(圖1C)。表明外泌體來(lái)源于乳腺癌細(xì)胞。類似的,外泌體抑制劑GW4869處理導(dǎo)致共培養(yǎng)的巨噬細(xì)胞中miR-138-5p的水平顯著下降,而KDM6B的水平顯著上升(圖1D-E)。乳腺癌細(xì)胞外泌體增加TPH-1細(xì)胞中miR-138-5p的表達(dá)但抑制KDM6B的表達(dá),但這種作用被miR-138-5p抑制劑處理廢除(圖3F-G)。轉(zhuǎn)染miR-138-5p mimic的乳腺癌細(xì)胞增加了外泌體miR-138-5p的水平(圖3H)。過(guò)表達(dá)miR-138-5p的乳腺癌細(xì)胞外泌體增加了miR-138-5p水平,抑制了THP-1細(xì)胞中KDM6B的表達(dá)(圖3I-J)。總之,這些結(jié)果表明,癌細(xì)胞分泌的外泌體miR-138-5p被傳遞到巨噬細(xì)胞中,并抑制KDM6B。
圖3 癌細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-138-5p下調(diào)KDM6B的表達(dá)
4、外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化
隨后,作者研究了在不同培養(yǎng)條件下TPH-1的表達(dá)譜。首先,和腫瘤細(xì)胞共培養(yǎng)抑制了M1相關(guān)基因的表達(dá),IL-6,TNF-α,和IL-1β,但是增加了M2相關(guān)基因的表達(dá)CD163,Arg-1,IL-10,TGF-β和VEGFA。過(guò)表達(dá)KDM6B部分抑制了上述表現(xiàn)改變(圖4A-B)。流式檢測(cè)顯示乳腺癌細(xì)胞和TPH-1的共培養(yǎng)增加了CD163陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)比例,但是過(guò)表達(dá)KDM6N可以抑制這種效果(圖6C)。類似的,過(guò)表達(dá)KDM6B抑制了miR-138-5p誘導(dǎo)的M2極化(圖4D-F)。與對(duì)照組相比,乳腺癌來(lái)源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關(guān)表型,相反,M2標(biāo)志物增加并伴隨著CD163陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)的增加(圖6G-I)。用從乳腺癌細(xì)胞中分離出來(lái)的外泌體處理THP-1細(xì)胞導(dǎo)致了M2極化,抑制miR-138-5p的表達(dá)可挽救這種極化(圖4J-L)??傊?,這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化。
圖4 外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化
5、KDM6B去甲基化酶活性增加了M1相關(guān)基因的表達(dá)
抑制KDM6B的組蛋白去甲基化酶活性可抑制其靶基因的轉(zhuǎn)錄。因此,使用雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)來(lái)分析M1靶基因的啟動(dòng)子活性。KDM6B的過(guò)表達(dá)特異性地刺激了促炎因子IL-6、IL-1β和TNF-α編碼基因的啟動(dòng)子活性(圖5A)。相反,沉默KDM6B活性則導(dǎo)致他們的啟動(dòng)子活性抑制,而過(guò)表達(dá)KDM6B降低了H3K27me3的水平(圖5B)。ChIP檢測(cè)顯示,與對(duì)照相比,THP-1細(xì)胞中KDM6B的過(guò)表達(dá)或敲除顯著增加或減少了KDM6B啟動(dòng)子在不同區(qū)域的占用(圖5C-D)。與此結(jié)果一致,啟動(dòng)子區(qū)域H3K27me3的募集會(huì)降低或增加當(dāng)KDM6B過(guò)表達(dá)或沉默時(shí)(圖5E-F)??傊?,下調(diào)KDM6B可提高H3K27me3水平和促炎因子編碼基因的轉(zhuǎn)錄活性,導(dǎo)致抑制M1極化。
圖5 KDM6B去甲基化酶活性增加了M1相關(guān)基因的表達(dá)
6、外泌體miR-138-5p促進(jìn)乳腺癌肺轉(zhuǎn)移
極化的巨噬細(xì)胞在決定腫瘤細(xì)胞的表型中起著重要的作用。因此,探究M2巨噬細(xì)胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺癌小鼠異腫瘤模型的腫瘤轉(zhuǎn)移。使用氯膦酸鈉清除小鼠巨噬細(xì)胞,然后轉(zhuǎn)移使用過(guò)表達(dá)miR-138-5p的T47D或T47D細(xì)胞來(lái)源的外泌體處理的Raw264.7細(xì)胞。小鼠模型通過(guò)尾靜脈注射4T1-熒光素酶細(xì)胞構(gòu)建(圖6A)。結(jié)果顯示,外泌體miR-138-5p處理組顯著促進(jìn)小鼠體內(nèi)乳腺癌細(xì)胞的腫瘤體積和肺轉(zhuǎn)移,同時(shí)增加了CD206和Arg-1陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)(圖6B-E)。這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p誘導(dǎo)的M2巨噬細(xì)胞促進(jìn)乳腺癌的肺轉(zhuǎn)移。
圖6 外泌體miR-138-5p促進(jìn)乳腺癌肺轉(zhuǎn)移
參考文獻(xiàn):
Xun Jing., Du Lingfang., Gao Ruifang., Shen Long., Wang Dekun., Kang Lichun., Chen Chuan'ai., Zhang Zhujun., Zhang Yuying., Yue Shijing., Feng Shuxin., Xiang Rong., Mi Xue., Tan Xiaoyue.(2021). Cancer-derived exosomal miR-138-5p modulates polarization of tumor-associated macrophages through inhibition of KDM6B. Theranostics, 11(14), 6847-6859. doi:10.7150/thno.51864