circExp:人類癌癥相關(guān) circRNA 表達(dá)的在線轉(zhuǎn)錄組平臺

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時間:2021-08-12
circExp數(shù)據(jù)庫收集整理了11個不同平臺上18種癌癥類型的48個circRNA表達(dá)譜,鑒定了 189193 個在正常和癌癥樣本......


circExp數(shù)據(jù)庫收集整理了11個不同平臺上18種癌癥類型的48circRNA表達(dá)譜,鑒定了 189193 個在正常和癌癥樣本之間顯著不同的差異表達(dá)特征的circRNA,為人類癌癥提供整合和標(biāo)準(zhǔn)化的 circRNA 表達(dá)譜。該數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果可以進(jìn)行批量下載。http://soft.bioinfo-minzhao.org/circexp

                                               


l   
Search


用戶可以通過3中途徑進(jìn)行搜索:circRNA名稱,實(shí)驗(yàn)設(shè)計,宿主蛋白。搜索結(jié)果包括circRNA來源的表達(dá)譜及表達(dá)譜全部circRNA的表達(dá)信息


l   
Browse


用戶可以根據(jù)癌癥類型進(jìn)行查詢,可以獲得circExp數(shù)據(jù)庫中該腫瘤所有表達(dá)譜:


l   
Annotation

當(dāng)用戶瀏覽某一表達(dá)譜時,點(diǎn)擊右上角“Check probe annotation”即可獲得該表達(dá)譜的注釋信息及熱圖:

 

l    Download

用戶可以免費(fèi)下載表達(dá)矩陣、差異表達(dá)列表、探針注釋信息以及GEO數(shù)據(jù)集: