淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是頭頸部鱗癌(HNSCC)患者預(yù)后不良的主要原因。N6甲基腺苷(m6A)RNA修飾是一種新興的基因表達表觀遺傳調(diào)控機制,IGF2BP2作為一種新的m6A讀取器蛋白參與腫瘤的進展和轉(zhuǎn)移。然而,目前對IGF2BP2在中的功能作用知之甚少,IGF2BP2是否通過m6A修飾在HNSCC中調(diào)節(jié)淋巴轉(zhuǎn)移仍有待確定。目前,有相關(guān)研究于2022年1月發(fā)表在《JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH》,IF: 11.161。
技術(shù)路線:
主要研究結(jié)果:
1. m6A調(diào)控因子在HNSCC中的表達及臨床意義
為了研究m6A修飾在HNSCC中的作用,從TCGA數(shù)據(jù)庫中分析了502個HNSCC和44個正常組織中20個m6A相關(guān)調(diào)控因子的表達譜。如圖1A和B所示,與正常組織相比,HNSCC組織中20個m6A調(diào)控基因中有18個顯著上調(diào),包括6個writers(VIRMA、ZC3H13、METTL14、METTL3、WTAP和RBM15)、2個erasers(FTO和ALKBH5)和10個readers(IGF2BP2、IGF2BP1、IGF2BP3、YTHDF3、YTHDF2、YTHDC1、YTHDF1、HNRNPC、RBMX和HNRNPA2B1)。HNSCC組織和正常組織中YTHDC2和RBM15B的表達水平無統(tǒng)計學(xué)差異。臨床相關(guān)性中,只有IGF2BP2的高表達與HNSCC患者較低的生存概率相關(guān)(圖1C)。Kaplan-Meier生存分析、多變量cox回歸分析后和病理N分期均表示IGF2BP2被確定為HNSCC中潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物(圖1C-1G)。
圖1 m6A調(diào)控因子在HNSCC中的表達及臨床意義
2. IGF2BP2在HNSCC組織中的高表達與淋巴轉(zhuǎn)移有關(guān)
臨床組織樣本中q-PCR和western blot均表示IGF2BP2在HNSCC腫瘤樣本中過表達(圖2A,2B)。通過臨床病理特征和隨訪數(shù)據(jù),IGF2BP2在NATs中表達量較低,在未發(fā)生淋巴轉(zhuǎn)移的HNSCC組織中表達量略有升高,但在有淋巴轉(zhuǎn)移的HNSCC組織中表達量強烈上調(diào)(圖2E,2F),且IGF2BP2高表達與較低的OS概率相關(guān)(圖2G)。此外,臨床病理特征分析顯示,IGF2BP2表達與病理N分型和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)(表1)。單因素和多因素Cox回歸分析顯示,IGF2BP2表達是HNSCC患者的獨立預(yù)后因素(表2)??傊@些結(jié)果表明,在HNSCC中IGF2BP2高表達,并在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用。
圖2 IGF2BP2在HNSCC組織中高表達,與淋巴轉(zhuǎn)移相關(guān)
3. IGF2BP2在體外促進HNSCC細胞的轉(zhuǎn)移行為
為了明確IGF2BP2是否能誘導(dǎo)HNSCC細胞的遷移和侵襲能力,對IGF2BP3進行敲降和過表達。通過RT-qPCR和western blot驗證了敲除和過表達的有效性(圖3A,3B)。創(chuàng)傷愈合分析表明,IGF2BP2的敲除抑制了FaDu和SCC15細胞的遷移能力,而過表達IGF2BP2后則出現(xiàn)相反的結(jié)果(圖3C,3D)。Transwell分析進一步證實了這一結(jié)果,顯示沉默IGF2BP2可減弱FaDu和SCC15細胞的遷移性和侵襲性,而過表達IGF2BP2則增強了細胞的轉(zhuǎn)移??傊@些數(shù)據(jù)表明IGF2BP2促進HNSCC細胞的遷移和侵襲。
圖3 IGF2BP2促進體外HNSCC細胞轉(zhuǎn)移行為
4. 在體內(nèi),IGF2BP2基因敲除可抑制淋巴轉(zhuǎn)移和淋巴管生成
為了進一步確定IGF2BP2在HNSCC淋巴轉(zhuǎn)移中的作用,使用裸鼠建立腘窩淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移模型(圖4A)。RT-qPCR和western blot驗證IGF2BP2的沉默效率(圖4B,4C),然后將這些細胞注射插入裸鼠中。4周后,通過體內(nèi)生物發(fā)光成像檢測IGF2BP2對淋巴轉(zhuǎn)移的影響。IGF2BP2基因敲除顯著抑制了HNSCC細胞的淋巴轉(zhuǎn)移(圖4D)。此外,sh-IGF2BP2組的腳掌腫瘤和腘窩淋巴結(jié)均比sh-NC組小、輕,提示IGF2BP2抑制了HNSCC的腫瘤發(fā)生和淋巴轉(zhuǎn)移(圖4E-J)。此外,sh-IGF2BP2組的LN轉(zhuǎn)移率低于sh-NC組(圖4K)。免疫組化分析顯示,沉默IGF2BP2顯著降低了小鼠組織瘤內(nèi)和瘤周區(qū)域的微淋巴管密度水平,這由lyve1陽性微血管表明(圖4L)。這些結(jié)果表明,在體內(nèi),IGF2BP2基因敲除顯著抑制淋巴轉(zhuǎn)移和淋巴管生成。
圖4體內(nèi)IGF2BP2基因敲除抑制淋巴轉(zhuǎn)移和淋巴管生成
5. IGF2BP2調(diào)控HNSCC細胞的EMT程序
為了分析IGF2BP2在調(diào)節(jié)EMT中的作用,用TGF-β處理FaDu和SCC15細胞。72小時后,觀察到細胞-細胞接觸減少,梭形形態(tài)為間充質(zhì)細胞(圖5A)。此外,免疫熒光染色和共聚焦成像分析顯示,經(jīng)TGF-β處理的FaDu和SCC15細胞形成了廣泛的絲狀足和板狀足,如白色箭頭所示,使細胞獲得了遷移和侵襲能力(圖5B)。此外,western blot分析顯示,TGF-β誘導(dǎo)兩種HNSCC細胞E-Cadherin表達減少,這被認為是EMT轉(zhuǎn)移的標(biāo)志(圖5C)。這些數(shù)據(jù)表明,經(jīng)TGF-β處理的HNSCC細胞系處于EMT過程中。
RT-qPCR和western blot分析顯示,在經(jīng)TGF-β處理的FaDu和SCC15細胞中,IGF2BP2缺失可下調(diào)N-Cadherin和vimentin的表達水平,而E- cadherin在mRNA和蛋白水平上上調(diào)(圖5D-E)。免疫熒光染色和共聚焦成像分析進一步證實,沉默IGF2BP2導(dǎo)致波形蛋白表達的丟失,同時在兩種HNSCC細胞的細胞表面E-Cadherin的保留,這表明IGF2BP2可能調(diào)節(jié)EMT程序(圖5F)。為了進一步證實IGF2BP2在EMT中的作用,在沒有TGF-β處理的情況下,用IGF2BP2和相應(yīng)的對照載體轉(zhuǎn)導(dǎo)FaDu和SCC15細胞,檢測了EMT相關(guān)標(biāo)記物,發(fā)現(xiàn)E-Cadherin確實下調(diào)了,而N-Cadherin和vimentin在mRNA和蛋白水平均上調(diào)(圖5G-H)。綜上所述,這些發(fā)現(xiàn)表明IGF2BP2在調(diào)節(jié)HNSCC細胞的EMT程序中具有重要的功能。
圖5 IGF2BP2調(diào)控HNSCC細胞EMT程序
6. 在HNSCC細胞中,Slug參與IGF2BP2調(diào)控的EMT
在HNSCC的TCGA數(shù)據(jù)庫中,spearman相關(guān)分析顯示,與Snail、ZEB1和Twist相比,在502份HNSCC組織樣本中,Slug和IGF2BP2之間的正相關(guān)性最強,表明在HNSCC中IGF2BP2和Slug之間可能存在正調(diào)控機制(圖6A)。此外,根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫,從IGF2BP2high表達的HNSCC組織到IGF2BP2low表達的HNSCC組織,再到正常的鄰近組織,均觀察到Slug的表達水平顯著降低(圖6B)。RT-qPCR和western blot分析顯示,抑制IGF2BP2顯著降低了FaDu和SCC15細胞中mRNA和蛋白水平的Slug表達,而過表達IGF2BP2顯著增強了Slug的表達(圖6C-F)。同時,在FaDu和SCC15細胞中,Snail、ZEB1和Twist的mRNA水平無顯著或一致的變化(圖6C)。western blot分析結(jié)果顯示,在FaDu細胞中,敲除Slug可拮抗過表達IGF2BP2誘導(dǎo)的波形蛋白上調(diào)和E-Cadherin下調(diào)(圖6G)。相反,在FaDu細胞中,IGF2BP2過表達部分逆轉(zhuǎn)了由Slug抑制引起的波形蛋白下調(diào)和E-Cadherin上調(diào)(圖6G)。此外,創(chuàng)傷愈合實驗表明,沉默Slug可減弱FaDu細胞中IGF2BP2過表達對細胞遷移的促進作用(圖6H)。另外,IGF2BP2高表達標(biāo)本表現(xiàn)為高Slug表達,而IGF2BP2低表達標(biāo)本表現(xiàn)為低至中等Slug表達(圖6I)。根據(jù)免疫組化定量評分,IGF2BP2與Slug表達呈穩(wěn)健的正相關(guān)(r =0.752, p-value < 0.001)(圖6 j)。這些發(fā)現(xiàn)表明,Slug在IGF2BP2調(diào)控的HNSCC EMT中具有關(guān)鍵作用。
圖6 Slug參與了HNSCC細胞中IGF2BP2調(diào)節(jié)的EMT
7. IGF2BP2通過修飾m6A調(diào)控slug mRNA的穩(wěn)定性
使用抗IGF2BP2抗體在FaDu和SCC15細胞中進行了RIP-qPCR檢測,結(jié)果顯示與IgG對照組相比,Slug mRNA顯著富集,證實了IGF2BP2和Slug mRNA之間的相互作用(圖7A)。為了驗證Slug是否受m6A修飾的影響,從而導(dǎo)致IGF2BP2識別甲基化Slug,我們進行了MeRIP qPCR分析,并確定與相應(yīng)的對照細胞相比,IGF2BP2的敲除顯著降低了FaDu和SCC15細胞中Slug的m6A水平(圖7B)?;?/span>SRAMP軟件分析,在Slug mRNA的CDS區(qū)域發(fā)現(xiàn)了一個非??尚诺?/span>m6A位點(圖7C)。為了驗證假設(shè)的m6A位點,使用含有野生型(WT) Slug-CDS或突變型(MT) Slug-CDS序列的熒光素酶報告基因進行了檢測(圖7D)。如預(yù)期的那樣,當(dāng)IGF2BP2沉默時,SlugWT的熒光素酶活性顯著減弱,而Slug-MT的熒光素酶活性似乎不受影響(圖7E)。此外,mRNA穩(wěn)定性分析顯示,在FaDu和SCC15細胞中,IGF2BP2沉默后,Slug mRNA的表達量降低,且Slug mRNA的半衰期持續(xù)縮短(圖7F)??偟膩碚f,這些發(fā)現(xiàn)表明IGF2BP2以m6A修飾依賴的方式直接將CDS區(qū)與Slug mRNA結(jié)合并穩(wěn)定其mRNA。
圖7 IGF2BP2通過修飾m6A調(diào)控slug mRNA的穩(wěn)定性
結(jié)論:
綜上所述,該研究首次揭示了IGF2BP2在促進HNSCC淋巴轉(zhuǎn)移中的臨床和生物學(xué)功能,并證明IGF2BP2通過穩(wěn)定Slug mRNA,以m6A依賴的方式促進EMT和細胞轉(zhuǎn)移(圖7G)。這些結(jié)果表明,IGF2BP2可以作為LN轉(zhuǎn)移的預(yù)測生物標(biāo)志物,也是HNSCC患者抗轉(zhuǎn)移治療的潛在靶點。
參考文獻:
Yu D, Pan M, Li Y, Lu T, Wang Z, Liu C, Hu G. RNA N6-methyladenosine reader IGF2BP2 promotes lymphatic metastasis and epithelial-mesenchymal transition of head and neck squamous carcinoma cells via stabilizing slug mRNA in an m6A-dependent manner. J Exp Clin Cancer Res. 2022, 41(1):6.